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パーミッションとは、フォルダ、ファイルに対するアクセス権限のことです。
どのフォルダ、ファイルに、どの程度のアクセス権「読み込み・書き込み・実行」を与えるのかを設定することができます。
アクセス権は、オーナー（自分）、グループ、その他の三者にそれぞれの権限を設定しなければなりません。

パーミッションには、数値で表す方法と、アルファベットで表す方法の2通りあります。
数値では「755」などと表記し、アルファベットでは「rwxr-xr-x」と表記します。

ファイル パーミッション	意味
読み込み （ 4、r ）	ファイルの内容を読む権限
書き込み （ 2、w ）	ファイルへ書き込む権限
実行 （ 1、x ）	ファイルを実行ファイルとして実行する権限

ディレクトリ パーミッション	意味
読み込み （ 4、r ）	ディレクトリ下にあるファイルやディレクトリのリストを閲覧する権限
書き込み （ 2、w ）	ディレクトリ下に新しくファイルやディレクトリを作成する権限
実行 （ 1、x ）	ディレクトリ下に移動する権限

パーミッションを数値で表す

パーミッションをアルファベットで表す

パーミッションは、FTPソフトのFFFTPを使って簡単に変更する事もできます。
（FTPソフトでパーミッション変更は、そのソフトに機能がついている場合のみ可能です）

サーバーに接続後、右側のリスト（サーバー側）で、パーミッションを変更したいフォルダ、またはファイルを選択します。
選択後、右クリックをするとメニューが表示されますので、その中にある「属性変更」を選択してください。
すると、「属性の変更」という画面が表示されます。パーミッションは、この「属性の変更」画面で行います。

オーナー、グループ、その他の３つの囲まれた枠がありますので、それぞれチェックの有無でパーミッションを設定します。

チェックを付けると、その権限が与えられます。「現在の属性」は、チェックの状態（権限）を数値で表しています。
権限のチェックを変更すると、同時に「現在の属性」も変化します。
権限を変更後、「OK」ボタンをクリックし、変更した権限を選択しているフォルダ、ファイルに設定を行います。
また、、「現在の属性」の数値を変更し、「OK」ボタンをクリックしてパーミッションを変更する事ができます。

チェック有無での権限設定や、数値での権限設定の両方が行えますので、使いやすい方で設定されたらよいかと思います。

CGIは、suEXECで動作しています。
以下の様に設定してください。

ファイルの種類	推奨する設定	推奨しない設定
CGIファイル	700	755
ログファイル	600	666
ログディレクトリ	701 or 700	777

※このパーミッションはCGIの設定です。
　PHPにこのパーミッションを設定すると動作しませんのでご注意ください。

suEXECとは？